，新倭日增,圍興化,據(jù)平海衛(wèi)(莆田東南)為巢。戚繼光第三次赴義烏募兵萬人，奉命率中路軍與右路福建總兵俞大猷和左路廣東總兵劉顯協(xié)力作戰(zhàn)，攻克平海衛(wèi)，斬倭2200余，繳獲器械3900余件，救出被掠男女3000余。不久，升福建總兵，鎮(zhèn)守福建及浙江溫州、金華兩府，督理水陸軍務(wù)。同年冬，倭寇萬余圍仙游(今屬福建)，戚繼光領(lǐng)兵僅6000，遂行緩兵計，等待援兵，各個擊破，解仙游之圍。次年，乘勝追至同安縣王倉坪、漳浦縣蔡坡嶺，殲逃倭數(shù)千。四十四年，率水陸軍至梅嶺(在今詔安境)，圍剿勾結(jié)倭寇的海盜首領(lǐng)吳平，迫其逃至南澳島(今閩粵交界海域)。旋與廣東總兵俞大猷合攻南澳島，俘斬吳平部 1200余人，焚死、溺死逾5000人，毀船近百只，吳平遁逃(一說投海死)。奉命兼管廣東潮州(今潮安)、惠州及駐江西的伸威營軍務(wù)，擔負保衛(wèi)自浙江溫州至廣東惠州數(shù)千里的海防重任。與譚綸、俞大猷等抗倭名將浴血奮戰(zhàn)十余年