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    空前規(guī)模的人類基因組深度測序(人類進(jìn)行基因組測序有什么意義呢)

    夕陽紅 2024-05-22 01:53:49

    空前規(guī)模的人類基因組深度測序

    2016年07月22日訊 基因組先鋒Craig Venter領(lǐng)導(dǎo)的研究小組已經(jīng)對超過1萬人的基因組進(jìn)行了深度測序,這也許是迄今為止最大規(guī)模的高質(zhì)量測序研究

    。他們精細(xì)定位了個(gè)體基因組的差異,并展示了哪些突變特別容易引起疾病

    在這項(xiàng)研究中,研究小組對10,545個(gè)基因組進(jìn)行了測序

    ,每個(gè)的測序深度在30-40倍
    。研究人員報(bào)告稱,84%的基因組被自信地測序
    ,這個(gè)區(qū)域包含了92.5%的已知致病變異
    。每個(gè)新測序的基因組平均含有8,579個(gè)之前未知的變異,有些涉及到疾病
    ,有些不涉及
    。此外,每個(gè)基因組大約含有70萬個(gè)標(biāo)準(zhǔn)參考基因組中沒有的DNA堿基

    “我們的工作代表了目前深度測序人類基因組的最大努力

    ,”研究稱?div id="jfovm50" class="index-wrap">!斑@項(xiàng)研究鑒定出超過1.5億個(gè)變異
    ,其中大多數(shù)是罕見且未知的。此外
    ,這些數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)了基因組中高度不耐受變異的位點(diǎn)
    ,這對健康而言可能是至關(guān)重要的?div id="jfovm50" class="index-wrap">!?/p>

    這項(xiàng)研究于7月1日發(fā)表在BioRxiv網(wǎng)站上

    。Craig Venter是資深作者。Human Longevity公司和J. Craig Venter研究所的科學(xué)家參與了這項(xiàng)工作
    。BioRxiv是一個(gè)預(yù)印本服務(wù)器
    ,讓人第一時(shí)間了解快速發(fā)展的生命科學(xué)領(lǐng)域的研究。

    據(jù)《圣地亞哥聯(lián)合論壇報(bào)》報(bào)道

    ,Venter拒絕接受采訪
    ,因?yàn)橥性u審和出版過程尚未完成。不過
    ,其他科學(xué)家在讀過這項(xiàng)研究后表示
    ,他們留下了深刻的印象。

    加州大學(xué)舊金山分校的Atul Butte博士認(rèn)為

    ,這項(xiàng)研究的規(guī)模以及基因組的質(zhì)量
    ,讓人印象深刻。他認(rèn)為
    ,這種“深度測序”可獲得醫(yī)療級別的基因組
    ,對臨床應(yīng)用而言足夠可靠
    。這些基因組提供了有用的參考數(shù)據(jù)集,可用于未來個(gè)體基因組的比較

    Sanford Burnham Prebys Medical Discovery研究所的罕見病研究人員Hudson Freeze表示

    ,這是他所知道的第一項(xiàng)高質(zhì)量的大規(guī)模基因組研究
    ?div id="jpandex" class="focus-wrap mb20 cf">!笆占?萬多人的基因組并測序,這需要很大的勇氣
    ,”Freeze說
    。“只有Craig Venter
    ,擁有勇氣
    、財(cái)力和技術(shù)訣竅去完成這件事?div id="jpandex" class="focus-wrap mb20 cf">!?/p>

    Scripps轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究所的基因組信息學(xué)主任Ali Torkamani認(rèn)為

    ,這項(xiàng)研究將對基因組的了解延伸到外顯子組以外,“為臨床上所有重要的區(qū)域提供了一幅更完整圖像”
    。不過
    ,它的最大限制是缺乏身體健康方面的數(shù)據(jù)。

    對于后續(xù)研究

    ,Torkamani建議研究人員關(guān)注其他變異,而不僅僅是這項(xiàng)研究關(guān)注的SNP(單核苷酸變異)
    ?div id="jfovm50" class="index-wrap">!氨M管SNP是人類基因組中最豐富的變異類型,但還有許多臨床相關(guān)的變異
    ,沒有在這項(xiàng)研究中討論
    ,尤其是插入缺失、拷貝數(shù)變異及其他類型的結(jié)構(gòu)變異
    ,”Torkamani說

    人類進(jìn)行基因組測序有什么意義呢

    人類基因組測序意義如下:1、能夠有效反應(yīng)在正?div id="m50uktp" class="box-center"> ;蚴芸貤l件中表達(dá)的全基因的時(shí)空圖

    ,從而推動(dòng)基因新技術(shù)發(fā)展,促進(jìn)人類健康


    2
    、完善人類基因組研究涉及的倫理、法律和社會問題
    ,維護(hù)社會穩(wěn)定


    3
    、培訓(xùn)正確利用技術(shù)和資源進(jìn)行生物學(xué)研究的科學(xué)人才,推動(dòng)科技進(jìn)步和社會發(fā)展

    人類基因組計(jì)劃為什么只包括人類基因組DNA的30億個(gè)堿基對的序列

    由于測序速度的限制

    ,最初的人類基因組計(jì)劃只做了一個(gè)白人的全基因組測序,包括了30億個(gè)堿基對的序列信息
    。有人說白人
    、黑人、黃種人之間只有0.1%的差異
    ,所以當(dāng)時(shí)用一個(gè)人的信息代表了全球的人類基因組信息

    但是現(xiàn)在測序技術(shù)飛速發(fā)展,已經(jīng)測了1000個(gè)各種人的全基因組
    ,發(fā)現(xiàn)差別可以到0.5%以上
    。所以你的說法有正確的地方,就是未來的方向是對每個(gè)有需要的人測序
    !目前的價(jià)格是50000¥/人
    。以后會更便宜。
    至于基因組里包含的信息
    ,是海量信息
    ,除了已知的功能基因有30000個(gè),還有少量未知的基因
    ,但更多的是非編碼序列(即傳統(tǒng)認(rèn)為不編碼蛋白的序列)的信息分析
    ,它們包含的信息現(xiàn)在只知了九牛一毛。

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