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      劉小樂教授發(fā)布癌癥綜合分析法(分析法與綜合法的區(qū)別)

      佚名 2024-06-06 04:27:22

      劉小樂教授發(fā)布癌癥綜合分析法

      2016年08月25日訊 理解腫瘤與免疫系統(tǒng)的相互作用,是發(fā)現(xiàn)預后指標

      、降低藥物抗性和開發(fā)新藥的關鍵
      。為此
      ,哈佛大學的研究人員開發(fā)了一種能夠綜合性分析腫瘤免疫的計算方法
      。該方法可以對腫瘤浸潤免疫細胞進行評估
      ,幫助人們理解癌癥中的腫瘤-免疫互作

      研究人員將自己的算法用于癌癥基因組圖譜TCGA的一萬多個RNA-seq樣本

      ,涉及23種癌癥。他們評估了不同腫瘤的免疫浸潤水平
      ,分析了腫瘤浸潤免疫細胞的臨床關聯(lián)
      ,還預測了新的治療靶標。

      研究顯示

      ,MAGEA3是黑色素瘤的潛在免疫靶標
      ,但它不適用于非小細胞肺癌。在許多癌癥中
      ,SPAG5可以成為癌癥疫苗的靶標
      。研究還表明,根據(jù)CD8 T細胞的浸潤情況
      ,可以將高水平表達CTLA4的黑色素瘤分為兩類
      。這些數(shù)據(jù)可以幫助人們開發(fā)出更有效的癌癥疫苗和檢驗點阻斷療法。

      劉小樂教授青年時代就讀于天津南開中學

      , 1992 年考入北京大學生物系
      。1994 年轉(zhuǎn)學到美國史密斯女子學院 (Smith College) 雙修生物化學和計算機科學, 三年后以最高拉丁榮譽畢業(yè) (Summa Cum Laude, 授予全校積分最高的 1% 的畢業(yè)生)
      。2002 年于斯坦福大學取得生物醫(yī)學信息學博士和計算機科學輔修博士學位后
      , 被直接聘為哈佛大學終身制助理教授。她目前擔任哈佛大學公共衛(wèi)生學院生物統(tǒng)計與計算生物學系的終身正教授
      、Dana-Farber 腫瘤研究所功能性癌癥表觀遺傳組學中心主任
      , 和同濟大學生物信息學系教授并長江學者講座教授。

      劉小樂教授帶領的研究小組最近在國際著名學術期刊上發(fā)表了多項研究成果

      。五月三十日在Nature Genetics雜志上發(fā)布了一種新的計算方法
      ,該方法可以幫助人們用RNA-seq數(shù)據(jù)從頭組裝腫瘤浸潤T細胞的CDR3序列。腫瘤浸潤T細胞是從血液進入腫瘤的淋巴細胞
      。腫瘤浸潤T細胞大量存在
      ,說明機體啟動了對抗腫瘤的免疫反應

      高通量實驗中的噪音和偏好使高維基因組數(shù)據(jù)分析成為了一項很大的挑戰(zhàn)。劉小樂教授與和德克薩斯大學西南醫(yī)學中心合作對此進行了深入研究

      。他們開發(fā)了一種強大的計算方法--MANCIE
      ,并將其發(fā)表在今年四月的Nature Communications雜志上。

      劉小樂教授此前還在《NATURE REVIEWS GENETICS》上發(fā)表文章

      ,探討了NGS染色質(zhì)分析出現(xiàn)偏好的常見原因
      、如何判斷這些偏好、減少偏好對結論的影響
      。這篇綜述以DNA為中心,總結了NGS染色質(zhì)分析中最重要的經(jīng)驗教訓
      ,提出了一些解決偏好的分析策略

      分析法與綜合法的區(qū)別

      分析法和綜合法區(qū)別如下
      1、綜合法是把經(jīng)濟現(xiàn)象的各個部分

      、各個方面和各種因素聯(lián)系起來
      ,從總體上認識和把握經(jīng)濟現(xiàn)象的方法。以綜合法解應用題時
      ,先選擇兩個已知數(shù)量
      ,并通過這兩個已知數(shù)量解出一個問題,然后將這個解出的問題作為一個新的已知條件
      ,與其它已知條件配合
      ,再解出一個問題,一直到解出應用題所求解的未知數(shù)量

      2
      、分析法是把復雜的經(jīng)濟現(xiàn)象分解成許多簡單組成部分,分別進行研究的方法
      。用分析法解題時如果解題所需要的兩個條件
      ,(或其中一個條件)是未知的時候,就要分別求解找出這兩個(或一個)的條件
      ,一直到問題都是已知的時候為止

      在解決實際問題時常用的分析方法有哪些

      目前在實際工作中,通常采用的分析方法有五種:

      1、對比分析法

      也叫比較分析法

      ,是通過實際數(shù)與基數(shù)的對比來提示實際數(shù)與基數(shù)之間的差異
      ,借以了解經(jīng)濟活動的成績和問題的一種分析方法。在科學探究活動中
      ,常常用到對比分析法
      ,這種分析法與等效替代法相似。對比法
      , 戲劇常用的一種主要藝術手法
      。一般有三種對比:人物對比
      、場面對比、細節(jié)對比

      2

      、因素分析法

      又稱經(jīng)驗分析法,是一種定性分析方法

      。該方法主要指根據(jù)價值工程對象選擇應考慮的各種因素
      ,憑借分析人員的知識和經(jīng)驗集體研究確定選擇對象。該方法簡單易行
      ,要求價值工程人員對產(chǎn)品熟悉
      ,經(jīng)驗豐富,在研究對象彼此相差較大或時間緊迫的情況下比較適用
      ,缺點是無定量分析
      、主觀影響大。

      因素分析法是利用統(tǒng)計指數(shù)體系分析現(xiàn)象總變動中各個因素影響程度的一種統(tǒng)計分析方法

      ,包括連環(huán)替代法
      、差額分析法、指標分解法等
      。 因素分析法是現(xiàn)代統(tǒng)計學中一種重要而實用的方法
      ,它是多元統(tǒng)計分析的一個分支。使用這種方法能夠使研究者把一組反映事物性質(zhì)
      、狀態(tài)
      、特點等的變量簡化為少數(shù)幾個能夠反映出事物內(nèi)在聯(lián)系的、固有的
      、決定事物本質(zhì)特征的因素

      因素分析法的最大功用,就是運用數(shù)學方法對可觀測的事物在發(fā)展中所表現(xiàn)出的外部特征和聯(lián)系進行由表及里

      、由此及彼
      、去粗取精、去偽存真的處理
      ,從而得出客觀事物普遍本質(zhì)的概括
      。其次,使用因素分析法可以使復雜的研究課題大為簡化
      ,并保持其基本的信息量

      3、相關分析法

      揭示某一礦區(qū)鉆孔自然彎曲趨勢的另一方法是進行相關分析

      ,又稱回歸分析
      ,即利用數(shù)理統(tǒng)計原理,求出反映鉆孔自然彎曲趨勢的回歸方程。通常設孔深為自變量
      ,頂角和方位角為因變量
      ,建立相關關系式這兩個相關關系式就代表鉆孔頂角和鉆孔方位角隨孔深而變化的規(guī)律

      4、差額計算法

      確定引起某個經(jīng)濟指標變動的各個因素的影響程度的一種計算方法

      。與"連續(xù)替代法"內(nèi)容相同
      。在幾個相互聯(lián)系的因素共同影響著某一個經(jīng)濟指標的情況下,可應用這一方法計算各個因素對該經(jīng)濟指標發(fā)生變動的影響程度
      。在衡量某一因素對于一個經(jīng)濟指標的影響時
      ,假定只有這一因素變動,而其余因素不變
      。確定各個因素替代順序
      ,然后按照這一順序進行替代計算。這種方法是假定各個因素依照一定的順序發(fā)生變動而進行替代計算的
      , 因此分析出來的結果具有一定程度的假定性

      5、比例法

      比例法亦稱“間接計算法”

      。它是利用過去兩個相關經(jīng)濟指標之間長期形成的穩(wěn)定比率來推算確定計劃期有關指標的一種方法。

      擴展資料

      分析法是“綜合法”的對稱

      。把復雜的經(jīng)濟現(xiàn)象分解成許多簡單組成部分
      ,分別進行研究的方法。其實質(zhì)是: 通過調(diào)查研究
      ,找出事物的內(nèi)在矛盾
      ,并對矛盾的各個方面進行深入研究。剔除那些偶然的
      、非本質(zhì)的東西
      ,抽象出必然的、本質(zhì)的因素
      ,并由此得出一些反映本質(zhì)的簡單規(guī)定
      ,以把握矛盾的各個方面的特殊性。

      分析法所提供的只是對于經(jīng)濟現(xiàn)象的片面理解

      ,它還不能從總體上
      、從各個部分之間的相互聯(lián)系上來把握經(jīng)濟現(xiàn)象。因此
      ,在分析的基礎上
      ,還必須運用綜合的方法,使分析得到的各個方面的本質(zhì)規(guī)定
      ,按照經(jīng)濟現(xiàn)象內(nèi)在的邏輯聯(lián)系
      ,形成有機的體系,這樣才能全面
      、深刻地認識經(jīng)濟現(xiàn)象
      ,提出解決問題的有效辦法

      適用范圍:不易直接證明結論;從結論很顯然能推出明顯正確的條件

      參考資料:百度百科-分析法

      本文地址:http://m.mcys1996.com/jiankang/302999.html.

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